Οι θάλασσες του Γεωπάρκου Λέσβου είναι ιδανικές για θαλάσσιο καγιάκ. Στη Λέσβο υπάρχει η δυνατότητα ενοικίασης καγιάκ και με τη βοήθεια συνοδού η δυνατότητα διάσχισης των θαλασσών της Λέσβου αλλά και η προσέγγιση λιγότερο δημοφιλών παραλιών.
Διοργανώνονται επίσης πολυήμερες εκδρομές, διάρκειας από μία έως δύο εβδομάδες. Τα καγιάκ είναι κλειστού τύπου, ενός ή δύο ατόμων, κατάλληλα για μεγάλες αποστάσεις, αλλά και για τη μεταφορά των απαραίτητων εφοδίων για το ταξίδι.